Actualmente, Interairports cobra en el Villeda Morales y en los otros aeropuertos US$48,44 por la salida internacional. Esta suma es cargada al precio del boleto aéreo que paga el pasajero.
En las últimas dos décadas, los operadores de todos los aeropuertos de Centroamérica invirtieron en la ampliación y modernización de las terminales, pero el Ramón Villeda no ha cambiado en 20 años.