Hernández fue detenido por orden de la Fiscalía General, dijo la Policía Nacional Civil en un comunicado.
La Fiscalía señaló en su cuenta de Twitter que Hernández fue detenido por cometer 'actos arbitrarios' en su cargo.
Según la Fiscalía, la detención está relacionada con el 'manejo de fondos' que obtienen tiendas que la Dirección General de Centros Penales maneja dentro de las prisiones, en las cuales venden artículos de primera necesidad a los reclusos.
Un portavoz de la Fiscalía dijo a la AFP que 'por el momento no se puede adelantar más detalles' sobre la detención de Hernández y las causas que se le imputan.
Tras ser detenido, el director de centros penales fue trasladado a una delegación policial en San Salvador, señaló la policía.